W skład Wydziału Kontroli wchodzą następujące samodzielne stanowiska pracy do spraw:

• Samodzielne stanowisko pracy do spraw organizacyjno-administracyjnych
• Samodzielne stanowisko pracy do spraw desygnacji
• Wieloosobowe samodzielne stanowisko pracy do spraw kontroli krajowej
• Samodzielne stanowisko do spraw budżetu i pomocy technicznej